Dodano środa, Czerwiec 29, 2011 przez Jarek Skrzypiec in Trakeny...i nie tylko z naukowego punktu widzenia |

Jacek Łojek, Zuzanna Nowak, Magdalena Saracyn

POLIMORFIZM ALLELI 4 WYBRANYCH SEKWENCJI MIKROSATELITARNYCH W POPULACJI KRAJOWYCH KONI POCHODZENIA TRAKEŃSKIEGO ? WSCHODNIOPRUSKIEGO, KONI TRAKEŃSKICH Z NIEMIEC I KONI INNYCH RAS

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego, Katedra Szczegółowej Hodowli Zwierząt,     Zakład Hodowli Koni
02-786 Warszawa, ul. Ciszewskiego 8 , jacek_lojek@sggw.pl

WSTĘP:
Celem pracy było zbadanie podobieństwa genetycznego między końmi pochodzenia trakeńskiego/wschodniopruskiego a końmi innych ras krajowych i zagranicznych poprzez porównanie polimorfizmu 4 wybranych sekwencji mikrosatelitarnych zlokalizowanych na chromosomie X.

MATERIAŁ I METODY:

W badaniach uwzględniono materiał genetyczny od 146 koni, które podzielono na 6 grup według przynależności rasowej: 1. Konie hodowli SK Liski oraz hodowli prywatnej wywodzące się od przodków rasy trakeńskiej lub wschodniopruskiej (n=91), 2. Konie rasy trakeńskiej pochodzące z Niemiec (Dolna Saksonia) (n=20), 3. Konie prymitywne (koniki polskie, hucuły) i kuce wierzchowe (n=12), 4. Konie półkrwi angielskiej beż przodków rasy trakeńskiej lub wschodniopruskiej w rodowodzie (n=10), 5. Konie półkrwi hodowli zagranicznej (n=9), 6. Konie ras czystych – pełnej i czystej krwi oraz fryzyjski (n=4). Stopień polimorfizmu PIC (Polymorphism Information Content) obliczany był według wzoru Botsteina i wsp. (1980). Współczynnik heterozygotyczności poszczególnych loci obliczano według wzoru Otta (1992).

WYNIKI I DYSKUSJA:
Długość analizowanych fragmentów wahała się od 158 do 317 pz. Trzy badane mikrosatelity okazały się bardzo wysokim polimorfizmem. Zidentyfikowano po 20 alleli w loci LEX 27 i LEX 28 i 19 alleli w locus UM 01. Czwarta z wybranych sekwencji mikrosatelitarnych okazała się całkowicie monomorficzna. W locus LEX 03 zidentyfikowano tylko 2 allele. Analizując rozkład alleli w grupach rodowodowych koni (1 ? 6) stwierdzono, że bez względu na rodzaj analizowanej sekwencji mikrosatelitarnej największa różnorodność alleli występowała w grupie 1 (konie pochodzenia trakeńskiego). Najmniej polimorficzna we wszystkich przypadkach była grupa 6 (konie ras czystych). Stwierdzono wysokie wartości współczynnika heterozygotyczność (HET) obliczanego dla 3 wysoko polimorficznych loci co świadczy  dużej zmienności wewnątrzpopulacyjnej. Największe wartości osiągał współczynnik obliczany dla grupy 1 (konie pochodzenia trakeńskiego) a najmniejszą w grupie 6 (konie ras czystych). Stopień polimorfizmu PIC obliczany dla wymienionych locus były zbliżone do wartości heterozygotyczności i przyjmowały najwyższe wartości grupie 1 a najniższe w grupie 6.

PODSUMOWANIE I WNIOSKI:

We wszystkich grupach rodowodowych koni stwierdzono dużą zmienność i wysoki stopień heterozygotyczności pod względem badanych miejsc na chromosomie X. Konie pochodzenia trakeńskiego były grupą najbardziej zróżnicowaną w obrębie badanych loci, konie ras czystych – najmniej.